Mezi výhody membránových kompresorů patří produkce plynu -bez znečištění a úniku-, jednoduchá konstrukce a pohodlná údržba. Jsou široce používány v průmyslových odvětvích, jako je chemický, farmaceutický, potravinářský a elektronický průmysl, zejména v aplikacích vyžadujících vysoce-čisté plyny nebo při manipulaci s toxickými nebo škodlivými plyny. Výkonové parametry membránového kompresoru zahrnují především průtok, tlak, výkon a účinnost; uživatelé musí tyto parametry při výběru přizpůsobit svým konkrétním potřebám.
Zásadní je také výběr materiálu membrány. Mezi běžné materiály membrán patří pryž a polytetrafluorethylen (PTFE), přičemž různé materiály jsou vhodné pro různá média a provozní podmínky. Životnost a výkon membránového kompresoru do značné míry závisí na kvalitě membrány a provozních podmínkách. Proto je během používání nutné pravidelně kontrolovat opotřebení membrány a včas ji vyměnit, aby byl zajištěn normální provoz zařízení.